Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC005779.1-201ENST00000591569 540 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC008750.4-201ENST00000600974 219 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CU639417.5-201ENST00000623983 476 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CU638689.3-201ENST00000624266 1031 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL121785.1-201ENST00000624745 708 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RASSF3-206ENST00000637125 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC006974.2-201ENST00000637240 1227 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC009122.1-201ENST00000640559 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RSRC1-215ENST00000611884 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SLMAP-220ENST00000495364 1383 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GIMAP2-201ENST00000223293 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ANKRD39Q53RE8 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ANKRD39Q53RE8 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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ANKRD39Q53RE8 AC018647.1-201ENST00000432866 1414 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ANKRD39Q53RE8 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ANKRD39Q53RE8 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01054-201ENST00000446989 514 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL049564.1-201ENST00000449099 825 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC005105.1-201ENST00000454851 792 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RFTN1P1-202ENST00000455527 996 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SL125P-201ENST00000480790 294 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02006-203ENST00000493214 812 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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