Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms