Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms