Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTCH1Q13635 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTCH1Q13635 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTCH1Q13635 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTCH1Q13635 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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