Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CDH18Q13634 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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