Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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