Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 TCF4-241ENST00000568740 2628 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TRHP20396 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 CDH13-202ENST00000428848 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 CACNB4-209ENST00000534999 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 COL17A1-203ENST00000393211 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 TRIM51-202ENST00000449290 1629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC01299-201ENST00000520902 2634 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 DNASE1-202ENST00000407479 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 AP000552.1-201ENST00000447720 3215 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TRHP20396 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 ATL1-201ENST00000358385 2647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 MPP4-212ENST00000620095 2364 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC104825.2-201ENST00000505448 3249 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 NPAP1P4-201ENST00000443325 3310 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 MYO1H-201ENST00000310903 4364 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.1 ms