Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C4BP0C0L5 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms