Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms