Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms