Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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