Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CIPCQ9C0C6 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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CIPCQ9C0C6 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CIPCQ9C0C6 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CIPCQ9C0C6 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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CIPCQ9C0C6 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CIPCQ9C0C6 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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