Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LRRIQ1Q96JM4 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC8.59□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms