Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms