Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AMPH-202ENST00000356264 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RPL36A-HNRNPH2-201ENST00000409170 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL133387.3-201ENST00000450669 522 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RN7SKP241-201ENST00000464584 291 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC104063.1-201ENST00000504840 702 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC133565.1-201ENST00000569218 488 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC002401.3-201ENST00000620020 440 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MAPK10-232ENST00000515400 2076 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SMIM12-204ENST00000446026 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 WISP3-204ENST00000368666 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC012467.2-201ENST00000607783 2583 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC124319.2-201ENST00000575034 3651 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TCF4-226ENST00000565018 2357 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF143-204ENST00000396604 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DLEU1-212ENST00000469754 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CARD8-216ENST00000520153 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CCDC15-203ENST00000529051 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNA5SP209-201ENST00000411237 97 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC00676-201ENST00000416090 474 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
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