Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RPS29P62273 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RPS29P62273 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms