Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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