Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL355922.4-201ENST00000555642 449 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPREP23469 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTPREP23469 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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