Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GLI3P10071 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GLI3P10071 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
GLI3P10071 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GLI3P10071 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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