Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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