Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms