Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
ERVV-1B6SEH8 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ERVV-1B6SEH8 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms