Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms