Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC7□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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