Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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