Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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