Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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GRIK4Q16099 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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GRIK4Q16099 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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GRIK4Q16099 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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GRIK4Q16099 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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