Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms