Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms