Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 Z82209.2-201ENST00000623410 2012 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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