Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EIF4EBP1Q13541 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms