Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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