Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC02489-201ENST00000527239 354 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL117190.2-201ENST00000554041 289 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MAPK10-255ENST00000641020 2412 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MEF2C-229ENST00000627659 2393 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF233-201ENST00000391958 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL445231.1-201ENST00000445523 1814 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MAGOHB-201ENST00000320756 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC104051.2-201ENST00000518934 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 C3P1-202ENST00000497718 4954 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CLUAP1-212ENST00000576634 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HCG21-204ENST00000419481 605 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CTLA4-204ENST00000472206 277 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC02318-202ENST00000556346 715 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ABLIM1-205ENST00000369266 2230 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 KIAA0391-205ENST00000603544 2232 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LRRC4C-203ENST00000528697 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MAPK10-316ENST00000641430 2285 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
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