Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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