Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXA13P31271 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXA13P31271 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXA13P31271 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXA13P31271 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXA13P31271 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXA13P31271 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXA13P31271 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXA13P31271 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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