Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ARL2BPP7-201ENST00000446421 490 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AP001527.1-201ENST00000566440 1957 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 KCNS3-202ENST00000403915 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms