Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C17orf47Q8NEP4 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 577.4 ms