Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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CCDC93Q567U6 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CCDC93Q567U6 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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