Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TUBBP6-201ENST00000416519 1332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP246-201ENST00000364553 317 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 REG3A-203ENST00000409839 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP29-201ENST00000410988 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ASS1P6-201ENST00000421118 1234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PDGFC-202ENST00000422544 849 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC104794.1-201ENST00000425235 312 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP68-201ENST00000434621 1008 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPS29P3-201ENST00000439929 171 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ABCA9-AS1-201ENST00000458677 523 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC106820.1-201ENST00000468708 420 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPL3P6-201ENST00000474162 1204 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GJA1P1-201ENST00000511478 1143 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTND6P25-201ENST00000528711 516 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC018716.1-201ENST00000534604 561 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ANAPC15-216ENST00000545680 872 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC002375.1-201ENST00000551161 581 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC091544.2-201ENST00000555864 414 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02178-201ENST00000566876 425 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NDUFB10P2-201ENST00000568872 478 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SL616P-201ENST00000584555 269 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL627309.8-201ENST00000595919 284 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC123912.4-201ENST00000596996 1178 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HIST1H4G-201ENST00000611444 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC007336.2-201ENST00000611626 557 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL138995.1-201ENST00000614633 675 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SL575P-201ENST00000620774 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TARS-216ENST00000627006 171 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRIO-225ENST00000639876 769 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC65-201ENST00000266984 2084 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms