Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL24A1Q17RW2 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms