Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NDUFA9Q16795 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NDUFA9Q16795 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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