Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms