Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SS18Q15532 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
SS18Q15532 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SS18Q15532 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SS18Q15532 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SS18Q15532 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SS18Q15532 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SS18Q15532 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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SS18Q15532 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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SS18Q15532 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SS18Q15532 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SS18Q15532 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SS18Q15532 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SS18Q15532 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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