Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4BQ13620 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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