Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SP140Q13342 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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