Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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