Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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