Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC130456.1-201ENST00000565085 1363 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC021506.1-201ENST00000581971 597 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms