Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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