Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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